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Patent 3017720 Summary

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Claims and Abstract availability

Any discrepancies in the text and image of the Claims and Abstract are due to differing posting times. Text of the Claims and Abstract are posted:

  • At the time the application is open to public inspection;
  • At the time of issue of the patent (grant).
(12) Patent Application: (11) CA 3017720
(54) English Title: PROCEDE DE DIAGNOSTIC DE MALADIES INFLAMMATOIRES CHRONIQUES DE L'INTESTIN
(54) French Title: PROCESS FOR DIAGNOSING CHRONIC INFLAMMATORY INTESTINAL DISEASES
Status: Examination
Bibliographic Data
(51) International Patent Classification (IPC):
  • A61B 5/00 (2006.01)
  • A61B 1/00 (2006.01)
  • A61B 1/31 (2006.01)
(72) Inventors :
  • BREGEON, JEREMY (France)
  • NEUNLIST, MICHEL (France)
  • CORON, EMMANUEL (France)
(73) Owners :
  • CHU DE NANTES - CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE NANTES
  • INSERM - INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE
  • NANTES UNIVERSITE
(71) Applicants :
  • CHU DE NANTES - CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE NANTES (France)
  • INSERM - INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (France)
  • NANTES UNIVERSITE (France)
(74) Agent: ROBIC AGENCE PI S.E.C./ROBIC IP AGENCY LP
(74) Associate agent:
(45) Issued:
(86) PCT Filing Date: 2017-03-15
(87) Open to Public Inspection: 2017-09-21
Examination requested: 2022-03-09
Availability of licence: N/A
Dedicated to the Public: N/A
(25) Language of filing: French

Patent Cooperation Treaty (PCT): Yes
(86) PCT Filing Number: PCT/FR2017/050586
(87) International Publication Number: WO 2017158286
(85) National Entry: 2018-09-13

(30) Application Priority Data:
Application No. Country/Territory Date
1652150 (France) 2016-03-15

Abstracts

English Abstract

The invention relates to a process for quantifying changes in the intestinal mucosa caused by a chronic inflammatory intestinal disease in individuals, an ex vivo process for diagnosing a chronic inflammatory intestinal disease in individuals, and an ex vivo process for the differential diagnosis of Crohn's disease versus ulcerative colitis in individuals.


French Abstract

La présente invention se rapporte à un procédé de quantification des modifications de la muqueuse intestinale induite par une maladie inflammatoire chronique de l'intestin chez un individu, un procédé ex vivo pour le diagnostic d'une maladie inflammatoire chronique de l'intestin chez un individu ainsi qu'à un procédé ex vivo pour le diagnostic différentiel de la maladie de Crohn par rapport à la rectocolite hémorragique chez un individu.

Claims

Note: Claims are shown in the official language in which they were submitted.


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REVENDICATIONS
1. Procédé ex vivo de quantification des modifications de la muqueuse
intestinale induite par une maladie inflammatoire chronique de l'intestin
chez un individu, ledit procédé comprenant les étapes de :
1) mesure, sur une image endomicroscopique confocale de la muqueuse
digestive d'un individu, des paramètres des profils des puits de cryptes
(PPC) suivants :
a) Fuite de fluorescence de la muqueuse (FF),
b) Périmètre d'ouverture du puits de crypte (PO),
c) Rotondité du puits de crypte (Roto),
d) Rondeur du puits de crypte (Rond),
e) Diamètre de Feret du puits de crypte (Feret),
f) Facteur d'élongation du puits de crypte (FE),
g) Rapport des axes d'ouverture du puits de crypte (Ma/ma),
h) Densité de crypte par champs (Dens) ;
2) quantification des modifications des paramètres a) à h) par rapport à
aux paramètres correspondants d'un individu sain.
2. Procédé ex vivo pour le diagnostic d'une maladie inflammatoire
chronique de l'intestin chez un individu, ledit procédé comprenant les
étapes suivantes :
1) mesure, sur une image endomicroscopique confocale de la muqueuse
digestive d'un individu, des paramètres suivants :
a) Fuite de fluorescence de la muqueuse (FF),
b) Périmètre d'ouverture du puits de crypte (PO),
c) Rotondité du puits de crypte (Roto),
d) Rondeur du puits de crypte (Rond),
e) Diamètre de Feret du puits de crypte (Feret),
f) Facteur d'élongation du puits de crypte (FE),
g) Rapport des axes d'ouverture du puits de crypte (Ma/ma),

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h) Densité de crypte par champs (Dens) ;
2) sélection des valeurs qualifiées extrêmes supérieures , supérieures
aux seuils définis ci-dessous pour chaque paramètre :
- PO > 474,62 ~ 103,10 µm,
- Roto > 98,96 ~ 0,56 %,
- Rond >68,43 ~ 14,41 %,
- Feret >169,88 ~ 51,08 µm,
- FE >1,745 ~ 0,266,
- Ma/ma >1,653 ~ 0,247,
- Dens >0,2837 ~ 0,0505 ;
3) comparaison, pour chaque paramètre, de la moyenne des valeurs
extrêmes supérieures et de la valeur moyenne de FF à un seuil
pathologique , ledit seuil pathologique étant défini, pour chaque paramètre,
de la manière suivante :
- FF>10,0 ~ 3,6 LUT.sec-1,
- PO>666,40 ~ 103,10 µm,
- Roto>99,32 ~ 0,56 %,
- Rond>73,00 ~ 14,41 %,
- Feret>186,11 ~ 51,08 µm,
- FE>1,87 ~ 0,266,
- Ma/ma>1,90 ~ 0,247,
- Dens>0,39 ~ 0,0505;
4) attribution des notes suivantes :
- si la moyenne des valeurs extrêmes supérieures de
chaque paramètre PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma et Dens, ou la valeur
moyenne de FF est inférieure au seuil pathologique, la note de 0 est
attribuée au paramètre correspondant,
- si la moyenne des valeurs extrêmes supérieures de
chaque paramètre PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma et Dens, ou la valeur
moyenne de FF est supérieure au seuil pathologique, la note de 1 est

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attribuée pour FF, PO, Rond, Feret, Dens et la note de 2 est attribuée pour
Roto, FE et Ma/ma,
5) multiplication de la somme des notes par la somme du nombre de
valeurs de chaque paramètre,
dans lequel un total supérieur à 204 ~ 110 définit l'individu comme atteint
d'une maladie inflammatoire chronique de l'intestin.
3. Procédé ex vivo pour le diagnostic différentiel de la maladie de Crohn
par rapport à la rectocolite hémorragique chez un individu, ledit procédé
comprenant les étapes définies dans la revendication 2, suivie, chez
l'individu définit comme atteint d'une MICI, d'une comparaison de la valeur
moyenne de FF et de la moyenne des valeurs extrêmes supérieures du
paramètre PO et Feret à un seuil différentiel défini de la manière suivante :
- FF>19,86 ~ 5,70 LUT.sec-1,
- PO>618,32 ~ 98,95 µm et
- Feret>204,68 ~ 29,65 µm,
dans lequel l'individu est défini comme atteint d'une rectocolite
hémorragique si, pour chacun des paramètres FF, PO et Feret, une valeur
supérieure au seuil différentiel correspondant est atteinte, ou
l'individu est défini comme atteint d'une maladie de Crohn dans le cas
contraire.
4. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, dans lequel le
nombre total de cryptes analysées dans ladite image endomicroscopique
de la muqueuse digestive est supérieur à 20.
5. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans
lequel les étapes de mesure, de sélection des valeurs, de comparaison et
d'attribution des notes sont automatisées au moyen d'un programme
informatique pour une analyse a posteriori des images d'endomicroscopie

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ou au moyen d'une solution intégrée au logiciel existant d'endomicroscopie
pour une analyse en temps réel.
6. Produit programme d'ordinateur téléchargeable depuis un réseau de
communication et/ou enregistré sur un support lisible par ordinateur et/ou
exécutable par un processeur, caractérisé en ce qu'il comprend des
instructions de code de programme pour la mise en oeuvre d'un procédé
selon l'une au moins des revendications 1 à 3, ledit programme
d'ordinateur étant exécuté sur un ordinateur ou un processeur.
7. Système comprenant un endomicroscope, des moyens de visualisation
et des moyens de calcul, pour la mise en oeuvre d'un procédé défini selon
l'une quelconque des revendications 1 à 3.
8. Système comprenant un endomicroscope confocal connecté à des
moyens de visualisation et un calculateur comprenant des moyens
d'analyse d'image pour mesurer sur une image endomicroscopique
confocale de la muqueuse digestive d'un individu, au moins un des
paramètres des profils des puits de cryptes (PPC) choisi parmi FF, PO,
Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma et Dens, et un comparateur adapté pour
comparer les mesures réalisées avec les valeurs correspondantes d'un
individu sain.
9. Système selon la revendication 8, caractérisé en ce que les moyens
d'analyse sont adaptés pour sélectionner des valeurs qualifiées extrêmes
supérieures , supérieures aux seuils définis ci-dessous pour chaque
paramètre :
- PO > 474,62 ~ 103,10 µm,
- Roto > 98,96 ~ 0,56 %,
- Rond >68,43 ~ 14,41 %,

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- Feret >169,88 ~ 51,08 µm,
- FE >1,745 ~ 0,266,
- Ma/ma >1,653 ~ 0,247,
- Dens >0,2837 ~ 0,0505;
et le comparateur est adapté pour comparer, pour chaque paramètre, la
moyenne des valeurs extrêmes supérieures et la valeur moyenne de
FF à un seuil pathologique défini, pour chaque paramètre, de la manière
suivante :
- FF>10,0 ~ 3,6 LUT.sec-1,
- PO>666,40 ~ 103,10 µm,
- Roto>99,32 ~ 0,56 %,
- Rond>73,00 ~ 14,41 %,
- Feret>186,11 ~ 51,08 µm,
- FE>1,87 ~ 0,266,
- Ma/ma>1,90 ~ 0,247,
- Dens>0,39 ~ 0,0505;
le calculateur comprenant en outre un générateur de notes connecté au
comparateur et adapté pour attribuer des notes suivantes :
- si la moyenne des valeurs extrêmes supérieures du
paramètre PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma ou Dens, ou la valeur
moyenne de FF est inférieure au seuil, la note de 0 est attribuée au
paramètre correspondant,
- si la moyenne des valeurs extrêmes supérieures du
paramètre PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma ou Dens, ou la valeur
moyenne de FF est supérieure au seuil, la note de 1 est attribuée pour FF,
PO, Rond, Feret, Dens et la note de 2 est attribuée pour Roto, FE et
Ma/ma,
et le calculateur comprenant en outre un multiplicateur adapter pour
multiplier de la somme des notes par la somme du nombre de valeurs de
chaque paramètre.

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10. Système selon la revendcation 9, dans lequel ledit comparateur est
adapté à comparer la valeur moyenne de FF et la moyenne des valeurs
extrêmes supérieures du paramètre PO et Feret à un seuil différentiel
défini de la manière suivante :
- FF>19,86 ~ 5,70 LUT.sec-1,
- PO>618,32 ~ 98,95 µm et
- Feret>204,68 ~ 29,65 pµm.

Description

Note: Descriptions are shown in the official language in which they were submitted.


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WO 2017/158286
PCT/FR2017/050586
PROCÉDÉ DE DIAGNOSTIC DE MALADIES INFLAMMATOIRES
CHRONIQUES DE L'INTESTIN
Domaine technique
La présente invention se rapporte à un procédé de quantification des
modifications de la muqueuse intestinale induite par une maladie
inflammatoire chronique de l'intestin chez un individu, un procédé ex vivo
pour le diagnostic d'une maladie inflammatoire chronique de l'intestin chez
un individu ainsi qu'a un procédé ex vivo pour le diagnostic différentiel de
la maladie de Crohn par rapport à la rectocolite hémorragique chez un
individu.
La présente invention trouve notamment une application dans le
domaine médical, notamment du diagnostic.
Dans la description ci-dessous, les références entre crochets (11)
renvoient à la liste des références présentée à la fin du texte.
État de la technique
La maladie de Crohn est une maladie inflammatoire chronique
pouvant atteindre n'importe quel segment du tube digestif, mais plus
particulièrement le grêle terminal (iléon) et le côlon, et peut
s'accompagner de manifestations extra-intestinales (articulaires, cutanées,
oculaires...). En France, son incidence est de l'ordre de 5 pour 100 000
habitants par an. Même si la maladie de Crohn peut survenir à tout âge,
elle est le plus souvent diagnostiquée à un âge entre 20 et 30 ans. Il s'agit
d'une maladie cryptogénétique, où différents facteurs sont retrouvés et
discutés (prédisposition génétique, facteurs immunologiques et
environnementaux). Elle est par ailleurs favorisée par le tabagisme et le
mode de vie dans les pays industrialisés.

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WO 2017/158286
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Le diagnostic de maladie de Crohn repose sur un faisceau
d'arguments, cliniques et paracliniques. Le diagnostic est habituellement
établi en période de poussée. Les manifestations cliniques dépendent de
la localisation de la maladie : douleurs abdominales, diarrhée et/ou
syndrome dysentérique, le plus souvent muco-hémorragique, atteinte de la
région ano-périnéale, avec parfois signes généraux et/ou manifestations
systémiques. S'y associent volontiers des anomalies biologiques
(syndrome inflammatoire, carences...). Ainsi, le diagnostic de maladie de
Crohn peut être difficile et nécessiter d'écarter les autres causes
d'atteintes
organiques intestinales (infectieuses, ischémiques, médicamenteuses,
radiques voire néoplasiques). De plus, la distinction entre maladie de
Crohn, notamment colique, et rectocolite hémorragique peut être délicate.
Avec la rectocolite hémorragique, la maladie de Crohn (MC) fait
partie des maladies dénommées MICI : maladies inflammatoires
chroniques intestinales. La rectocolite hémorragique (ou "RCH") est une
inflammation persistante de la muqueuse intestinale. Elle atteint toujours le
rectum et, de manière plus ou moins étendue, le colon. La RCH est une
affection qui se caractérise par une alternance de phases d'activité (ou
"poussées"), d'intensité variable, et de phases sans symptôme. Plus
courante dans les pays industrialisés, cette affection serait favorisée par
des prédispositions génétiques et un dysfonctionnement du système
immunitaire
Il existe à ce jour peu de critères cliniques ou biologiques permettant
de différencier la MC, en particulier colique (Tontini et al., World J.
Gastroenterol., 2016 Jan 21, Tontini et al., World J. Gastroenterol., 2016
Jan 21, 2016 Jan 21;22(3):1246-59 ([1])), de la RCH, ni de prédire
l'évolution de la maladie, c'est-à-dire la rechute ou la réponse à des
traitements.
De nombreuses maladies gastro-intestinales inflammatoires sont
caractérisées par des changements structurels de la muqueuse. Ces

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modifications sont en corrélation avec la gravité de la maladie, et peuvent
être un facteur prédictif d'évolution ou de réponse au traitement.
Parmi les principales caractéristiques structurelles utilisées pour le
diagnostic des lésions coliques de la muqueuse, l'étude du profil des puits
de cryptes (PPC) est largement reconnue. Les méthodes de détection du
PPC restent essentiellement descriptives, bien que des études récentes
aient montré qu'une approche quantitative et informatisée de l'analyse
d'image augmentait la sensibilité de la classification et diminuait les
variations d'analyses entre opérateurs.
Parmi les méthodes utilisées pour imager la muqueuse intestinale,
l'endomicroscopie confocale (EMC) est une technique innovante et en
temps réel. L'EMC est une technique d'imagerie endoscopique permettant
l'examen de la muqueuse digestive à un niveau cellulaire.
Toutefois, à ce jour, bien qu'il y ait des études ayant établies des
classifications qualitatives par l'EMC des MICI, peu d'études ont effectué
une analyse quantitative de ces modifications.
Les seules études réalisées ont porté sur l'analyse de la sévérité de
l'inflammation dans la MC ou la RCH.
Kiesslich et al. proposent une classification de la sévérité de
l'inflammation de la rectocolite hémorragique en trois grades (Aucune,
Moyenne à modérée, Sévère). Cette classification repose :
1-sur des modifications de l'architecture de la crypte intestinale, de la
distribution des cryptes dans la muqueuse,
2- sur la présence d'infiltrat cellulaire dans la muqueuse,
3- sur les modifications de l'architecture des vaisseaux sanguins de la
muqueuse.
Ces critères sont évalués de façon qualitative par l'opérateur
(Gastroenterology 2007,132 :874-882 ([2])).
Li et al. proposent une classification de la rectocolite hémorragique
en quatre grades (de A à D) suivant des critères morphologiques de la
crypte colique et d'arrangement des cryptes dans la muqueuse appréciés

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de façon qualitative par l'opérateur (Am J Gastroenterol 2010; 105:1391-
1396 ([3])). Cette analyse est corrélée significativement avec l'analyse
histologique.
Neumann et al. démontrent également l'utilité de l'endomicroscopie
confocale pour l'évaluation de la maladie de Crohn et proposent un score
d'activité endomicroscopique de la maladie de Crohn basé sur une
évaluation des modifications architecturales des cryptes, des vaisseaux et
de la lamina propria (Inflamm Bowel Dis. 2012 Dec;18(12):2261-9 ([4])).
Liu et al. ont quantifié la densité de trous épithéliaux chez des
patients atteints de la maladie de Crohn ou de rectocolite hémorragique. Ils
ont démontré une augmentation significative de la densité de ces trous
dans la population malade par rapport à la population saine (Gastrointest.
Endosc. 2011,73:1174-1180 ([5]).
Musquer et al. ont quantifié le rapport des axes d'ouverture de la
lumière des cryptes coliques chez des patients atteints de la maladie de
Crohn et ont établi un lien entre une augmentation de ce rapport et la
présence de la maladie et son stade (rémission/inflammation) (Dig Liver
Dis 2013,45 :487-492 ([6])).
Il existe donc un réel besoin de nouveau outils diagnostiques palliant
ces défauts, inconvénients et obstacles de l'art antérieur, en particulier
d'un procédé permettant de maîtriser le diagnostic des MICI, et notamment
de faire la distinction entre la MC et la RCH.
Description de l'invention
La présente invention permet précisément de résoudre et de
surmonter les obstacles et inconvénients de l'art antérieur précités en
fournissant d'une part une méthode d'analyse ainsi que des paramètres
caractéristiques des MICI, d'autre part l'application de cette méthode pour
discriminer des patients sains, des patients M ICI.
La présente invention fournit également des biomarqueurs d'imagerie
des MICI.

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Le Demandeur a réussi à mettre au point, aux termes d'importantes
recherches, un procédé basé sur l'analyse d'images, notamment
endomicroscopiques, et a ainsi défini un score issu de l'analyse
quantitative de ces images, données permettant de répondre aux besoins
5 définis précédemment.
Le Demandeur a en particulier développé une méthode de diagnostic
différentiel basé sur l'analyse des images d'endomicroscopie confocale
(EMC). Le Demandeur utilise de manière surprenante l'EMC pour évaluer
les changements structurels de la muqueuse dans les maladies
inflammatoires de l'intestin et réaliser un diagnostique des MICI, ainsi
qu'un diagnostic différentiel de la MC vs. la RCH.
Le score quantitatif créé par le Demandeur permet avantageusement
de différencier la MC de la RCH avec un facteur prédictif positif d'environ
83,3 % pour la MC et d'environ 100 % pour la RCH. Avantageusement, la
sensibilité de diagnostic de la MC est d'environ 100 % avec une spécificité
d'environ 87,5 %. La sensibilité de diagnostic de la RCH est
avantageusement d'environ 81,8 % avec une spécificité d'environ 100 %.
Le score proposé se base sur un examen simple réalisé par un
gastroentérologue, sans anesthésie, sans biopsies ou techniques
nécessitant de coproculture.
De manière avantageuse le score proposé permet un diagnostic
direct, c'est-à-dire sans temps de traitement par un autre service.
De manière avantageuse, la méthode proposée peut être mise en
oeuvre avec d'autres techniques d'imagerie fournissant des images
dynamiques de l'architecture microscopique de la muqueuse digestive,
comme les images obtenues au moyen d'endocytoscopes et/ou
d'endoscopes à fort grossisssement.
Ainsi, un premier objet de l'invention se rapporte à un procédé ex vivo
de quantification des modifications de la muqueuse intestinale
possiblement induite par une maladie inflammatoire chronique de l'intestin
chez un individu, ledit procédé comprenant les étapes de :

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1) mesure, sur une image endomicroscopique confocale de la muqueuse
digestive d'un individu, des paramètres des profils des puits de cryptes
(PPC) suivants :
a) Fuite de fluorescence de la muqueuse (FF),
b) Périmètre d'ouverture du puits de crypte (PO),
c) Rotondité du puits de crypte (Roto),
d) Rondeur du puits de crypte (Rond),
e) Diamètre de Feret du puits de crypte (Feret),
f) Facteur d'élongation du puits de crypte (FE),
g) Rapport des axes d'ouverture du puits de crypte (Ma/ma),
h) Densité de crypte par champs (Dens) ;
2) quantification des modifications des paramètres a) à h) par rapport aux
paramètres correspondants d'un individu sain.
On entend par modifications de la muqueuse intestinale
possiblement induite par une maladie inflammatoire chronique de
l'intestin , au sens de la présente invention, toute modification
microscopique, notamment cellulaire, de la muqueuse intestinale
provoquée par l'inflammation due à la MICI. Il peut s'agir par exemple de
modifications de la structure des puits de cryptes de la muqueuse colique
et/ou des cellules formant les puits. La modification peut être architecturale
et/ou dynamique. Par exemple, la modification peut se rapporter à l'un au
moins des paramètres suivants : Fuite de fluorescence de la muqueuse
(FF), Périmètre d'ouverture du puits de crypte (PO), Rotondité du puits de
crypte (Roto), Rondeur du puits de crypte (Rond), Diamètre de Feret du
puits de crypte (Feret), Facteur d'élongation du puits de crypte (FE),
Rapport des axes d'ouverture du puits de crypte (Ma/ma), Densité de
crypte par champs (Dens).
On entend par muqueuse digestive , au sens de la présente
invention, tout ou partie de la couche de cellules épithéliales la plus
superficielle de la paroi du tube digestif.

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Pour la mise en oeuvre de l'invention, la muqueuse digestive désigner
tout ou partie de la muqueuse intestinale. Il peut s'agir par exemple de tout
ou partie de la muqueuse colique.
Le procédé de l'invention permet, sur une image médicale de tout ou
partie de la muqueuse digestice d'un individu, de mesurer/calculer des
paramètres choisis par le Demandeur aux termes d'importantes
recherches, afin de quantifier des modifications de la muqueuse intestinale
possiblement induite par une maladie inflammatoire chronique de l'intestin
chez un individu.
La technique d'imagerie utilisée est de préférence
endomicroscopique confocale. Toutefois, les procédés de l'invention
peuvent être transposés à des techniques d'imagerie médicale
équivalentes, comme l'endocytoscopie (Neumann et al., Aliment
Pharmacol Ther. 2011 Jun ; 33(11):1183-93 ([7])) ou l'endoscopie à fort
grossissement (Kanesaka et al., Dig Endosc. 2014 Jan;26(1):57-62 ([8])).
On entend par Fuite de fluorescence de la muqueuse , au sens de
la présente invention, l'augmentation de la quantité de fluorescence de la
muqueuse intestinale, par rapport à un niveau de fluorescence à un instant
t et mesurée dans les dix minutes suite à une injection intraveineuse d'une
molécule fluorescente chez un individu. La molécule fluorescente peut être
toute molécule connue de l'homme du métier, par exemple la fluorescéine.
Toute méthode de mesure de la quantité de fluoresence de la muqueuse
intestinale connue de l'homme du métier peut être utilisée. Par exemple, la
quantité de fluorescence peut être mesurée image par image (12 images /
seconde) à partir des séquences d'endomicroscopie enregistrées . La fuite
de fluorescence est dans ce cas le résultat de la pente obtenue par la
régression linéaire de la quantité de fluorescence au cours du temps.
L'augmentation peut être une augmentation d'au moins 5%, ou au moins
10%, ou au moins 20%, ou au moins 50%, ou au moins 60%, ou au moins
80%, ou au moins 90%, ou 100%, de la fluorescence par rapport au niveau

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de fluorescence à l'instant t. Avantageusement, ce paramètre est un
paramètre dynamique, dont la valeur peut évoluer au cours du temps.
Dans le cadre de l'invention, la mesure des paramètres b) à h)
s'effectue après définition du contour de l'ouverture de la crypte par la
méthode mettant en oeuvre un contour actif suivant la méthode de
segmentation utilisant des splines exponentielles (Delgado-Gonzalo et al.
"Snakes on a Plane: A Perfect Snap for Bioimage Analysis," IEEE Signal
Processing Magazine, vol. 32, no. 1, pp. 41-48 ([9])).
On entend par Périmètre d'ouverture du puits de crypte , au sens
de la présente invention, la longueur du contour de l'ouverture de la crypte.
La longueur du contour de l'ouverture de la crypte peut être mesurée par
toute méthode connue et appropriée, par exemple par la méthode de
Delgado-Gonzalo et al. ([9]).
On entend par Rotondité du puits de crypte , le paramètre donné
par la formule 4 x 7 x Area / Périmètre d'ouverture du puits de crypte2
(Wadell, H., 1932, Volume, shape, and roundness of rock particles. Journal
of Geology 40:443-51 (DOM.
On entend par Rondeur du puits de crypte , au sens de la
présente invention, le paramètre suivant la définition de la norme ISO 1101
(ISO 1101:2012(E)). Il correspond au rapport normalisé entre les rayons
des cercles minimum et maximum inscrits dans le puits de crypte, exprimé
en pourcentage.
On entend par Diamètre de Feret du puits de crypte , au sens de
la présente invention, la distance maximale entre 2 points de la surface de
l'ouverture de crypte (M. R. Walter. Stromatolites. Elsevier. pp. 47¨. ISBN
978-0-444-41376-5 ([11])).
On entend par Facteur d'élongation du puits de crypte , au sens
de la présente invention, un facteur d'échelle donné par le ratio entre le
diamètre de l'élipse du grand axe ayant une forme la plus proche de
l'ouverture de la crypte (Dgrand axe) et le diamètre de l'élipse du petit axe
de

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l'élipse ayant une forme la plus proche de l'ouverture de la crypte (Dpetit
axe). Le facteur d'élongation étant donnée par Dgrand axe/ Dpetit axe =
On entend par Rapport des axes d'ouverture du puits de crypte ,
au sens de la présente invention, le ratio entre le grand axe et le petit axe
du rectangle contenant l'ouverture de crypte.
On entend par Densité de crypte par champs , au sens de la
présente invention, un ratio entre l'aire occupée par les ouvertures de puits
de crypte dans un champ de vue et l'aire totale du champ de vue.
On entend par procédé de quantification , au sens de la présente
invention, un procédé permettant d'évaluer quantitativement des
modifications de la muqueuse intestinale, par rapport à un individu sain,
c'est-à-dire ne souffrant pas d'une pathologie digestive inflammatoire.
On entend par image endomicroscopique confocale , au sens de
la présente invention, une image, une série d'images, ou la reconstitution
d'une seule image à partir d'une série d'image résultant de la mise en
oeuvre d'une endomicroscopie confocale. La série d'image peut par
exemple représenter une visualisation dynamique, notamment en temps
réel, de l'objet étudié. Il peut par exemple s'agir d'une vidéo.
La endomicroscopie confocale permet l'acquisition d'images chez
un patient, sans biopsies, suite à l'injection d'un agent de contraste
fluorescent, par exemple la fluorescéine, au cours d'une endoscopie.
Un autre objet de l'invention se rapporte à un procédé ex vivo pour le
diagnostic d'une maladie inflammatoire chronique de l'intestin chez un
individu, ledit procédé comprenant les étapes suivantes :
1) mesure, sur une image endomicroscopique confocale de la muqueuse
digestive d'un individu, des paramètres suivants :
a) Fuite de fluorescence de la muqueuse (FF),
b) Périmètre d'ouverture du puits de crypte (PO),
c) Rotondité du puits de crypte (Roto),
d) Rondeur du puits de crypte (Rond),
e) Diamètre de Feret du puits de crypte (Feret),

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f) Facteur d'élongation du puits de crypte (FE),
g) Rapport des axes d'ouverture du puits de crypte (Ma/ma),
h) Densité de crypte par champs (Dens) ;
2) sélection des valeurs qualifiées extrêmes supérieures , supérieures
5 aux seuils définis ci-dessous pour chaque paramètre :
- PO > 474,62 103,10 pm,
- Roto > 98,96 0,56 %,
- Rond >68,43 14,41 %,
- Feret >169,88 51,08 pm,
10 - FE >1,745 0,266,
- Ma/ma >1,653 0,247,
- Dens >0,2837 0,0505;
3) comparaison, pour chaque paramètre, de la moyenne des valeurs
extrêmes supérieures et de la valeur moyenne de FF à un seuil
pathologique , le seuil pathologique étant défini, pour chaque paramètre,
de la manière suivante :
- FF>10,0 3,6 LUT.5ec-1,
- PO>666,40 103,10 pm,
- Roto>99,32 0,56 %,
- Rond>73,00 14,41%,
- Feret>186,11 51,08 pm,
- FE>1,87 0,266,
- Ma/ma>1,90 0,247,
- Dens>0,39 0,0505;
4) attribution des notes suivantes :
- si la moyenne des valeurs extrêmes supérieures du
paramètre PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma ou Dens, ou la valeur
moyenne de FF est inférieure au seuil, la note de 0 est attribuée au
paramètre correspondant,
- si la moyenne des valeurs extrêmes supérieures du
paramètre PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma ou Dens, ou la valeur

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moyenne de FF est supérieure au seuil, la note de 1 est attribuée pour FF,
PO, Rond, Feret, Dens et la note de 2 est attribuée pour Roto, FE et
Ma/ma,
5) multiplication de la somme des notes par la somme du nombre de
valeurs de chaque paramètre,
dans lequel un total supérieur à 204 110 définit l'individu comme atteint
d'une maladie inflammatoire chronique de l'intestin.
Les paramètres a) à h) mesurés dans l'étape 1) ont été
spécifiquement sélectionnés par le Demandeur, au terme d'un processus
de recherche rigoureux, comme biomarqueurs d'imagerie d'intérêt, parmi
de nombreux autres paramètres architecturaux et dynamiques
susceptibles de subir des modifications dans les MICI. La combinaison de
ces biomarqueurs résulte également d'une sélection rigoureuse et
innovante. Ce groupe de biomarqueurs sélectionnés constitue ainsi un
groupe de paramètres à partir duquel les procédés de diagnostic de
l'invention sont mis en oeuvre.
Le Demandeur est également parvenu à définir un seuil, pour chacun
de ces paramètres, permettant de sélectionner, pour chaque paramètre,
les valeurs d'intérêt à considérer dans le processus de diagnostic des
MICI.
Ainsi, à l'issue de l'étape 1) de mesure des paramètres a) à h),
l'étape 2) permet la sélection des valeurs d'intérêt, qualifiées de valeurs
extrêmes supérieures , pour chacun des paramètres. Dans
l'étape
2), les seuils représentent, pour chaque paramètre PO, Roto, Rond, Feret,
FE, Ma/ma et Dens, le 90ème centile, soit la valeur la plus faible des 10%
des valeurs les plus fortes, obtenu à partir d'une population saine. Le seuil
est exclu des valeurs d'intérêt.
Le Demandeur est également parvenu à définir un seuil
pathologique , permettant de discriminer les valeurs susceptibles
d'indiquer la présence d'une MICI.

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On entend par seuil pathologique , au sens de la présente
invention, une valeur pour et/ou au-delà de laquelle le paramètre est
considéré comme possiblement indicateur d'une MICI. Dans l'étape 3), le
seuil pathologique représente, pour chaque paramètre PO, Roto, Rond,
Feret, FE, Ma/ma et Dens, la valeur permettant d'inclure au moins 60% de
la population MICI étudiée et d'exclure au moins 80% de la population
saine étudiée , ces valeurs étant calculées par exemple sur des
échantillons comprenant une dizaine de patients sains et une vingtaine de
patients atteints de MICI, notamment comme illustré dans l'exemple 1 ci-
après.
Dans le cadre de l'invention, le Demandeur enseigne la comparaison
de ce seuil pathologique avec d'une part la moyenne des valeurs
extrêmes supérieures de chacun des paramètres b) à h) et d'autre part
de la valeur moyenne de FF.
On entend par somme du nombre de valeurs de chaque
paramètre , au sens de la présente invention, la somme de toutes les
occurrences de chaque paramètre présentes sur l'image.
Selon l'invention, la multiplication de la somme des notes par la
somme du nombre de valeurs de chaque paramètre permet d'obtenir un
total , ou score, ou valeur de prédiction d'une MICI.
Un total supérieur 204 110 définit l'individu comme atteint d'une
MICI. A l'inverse, un score inférieur à 204 permet de classer l'individu
comme non atteint d'une maladie inflammatoire chronique de l'intestin. Le
nombre 204 110 est notamment défini par le score maximal observé
dans une population saine comprenant une dizaine de patients sains,
notamment comme illustré dans l'exemple 1 ci-après.
Un autre objet de l'invention se rapporte à un procédé ex vivo pour le
diagnostic différentiel de la maladie de Crohn par rapport à la rectocolite
hémorragique chez un individu, ledit procédé comprenant les étapes
définies précédemment pour le diagnostic d'une MICI, suivie, chez
l'individu définit comme atteint d'une MICI, d'une comparaison de la valeur

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moyenne de FF et de la moyenne des valeurs extrêmes supérieures du
paramètre PO et Feret à un seuil différentiel défini de la manière suivante :
- FF>19,86 5,70 LUT.5ec-1,
- PO>618,32 98,95 pm et
- Feret>204,68 29,65 pm,
dans lequel l'individu est défini comme atteint d'une rectocolite
hémorragique si, pour chacun des paramètres FF, PO et Feret, une valeur
supérieure au seuil différentiel correspondant est atteinte, ou
l'individu est défini comme atteint d'une maladie de Crohn dans le cas
contraire.
Le Demandeur est parvenu, au terme de recherches importantes, à
définir un seuil différentiel pour chacun des paramètres FF, PO et
Feret, ce seuil permettant un diagnostic, chez les individus définis comme
atteints de MICI, soit de la MC, soit de la RCH. Ces trois paramètres FF,
PO et Feret ont en effet été sélectionnés à ce stade par le Demandeur car
il a, de manière surprenante, observé une différence significative entre les
individus atteints de MC et ceux atteints de RCH.
Le seuil différentiel est défini, pour chaque paramètre FF, PO et
Feret, comme étant la valeur permettant qu'au moins une des populations
MICI, en d'autres termes au moins une population choisie parmi la
population MC et la population RCH, soit représentée à 100 % et que la
seconde, c'est-à-dire celle qui n'est pas représentée à 100%, le cas
échéant, soit représentée à au moins 80 %.
Quel que soit le procédé de l'invention utilisé, le nombre total de
cryptes analysées dans les images endomicroscopiques de la muqueuse
colique peut être au minimum de 32 10 cryptes pour un niveau de
confiance a de 0,05 et au minimun de 53 10 cryptes pour un niveau de
confiance a de 0,01. Il peut s'agir par exemple au minimum d'environ 20
crytpes, ou 40 cryptes, ou environ 80 cryptes, ou environ 90 cryptes, ou
environ 100 cryptes, ou environ 120 cryptes, analysées sur des zones
coliques distinctes choisies aléatoirement.

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Quel que soit le procédé de l'invention utilisé, les étapes de mesure,
de sélection des valeurs, de comparaison et d'attribution des notes
peuvent être automatisées au moyen d'un programme informatique pour
une analyse a posteriori des images d'endomicroscopie, par exemple avec
IC-viewer (IronCAD), ou au moyen d'une solution intégrée au logiciel
existant d'endomicroscopie pour une analyse en temps réel, par exemple
avec Cellvizio (Mauna Kea Technologies).
Un autre objet de l'invention se rapporte à un produit programme
d'ordinateur téléchargeable depuis un réseau de communication et/ou
enregistré sur un support lisible par ordinateur et/ou exécutable par un
processeur, comprenant des instructions de code de programme pour la
mise en oeuvre d'un des procédés de l'invention.
Un autre objet de l'invention se rapporte à un système comprenant un
endomicroscope, des moyens de visualisation et des moyens de calcul,
pour la mise en oeuvre d'un procédé défini précédemment.
Un autre objet de l'invention se rapporte à un système comprenant un
endomicroscope confocal connecté à des moyens de visualisation et un
calculateur comprenant des moyens d'analyse d'image pour mesurer sur
une image endomicroscopique confocale de la muqueuse digestive d'un
individu, au moins un des paramètres des profils des puits de cryptes
(PPC) choisi parmi FF, PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma et Dens, et un
comparateur adapté pour comparer les mesures réalisées avec les valeurs
correspondantes d'un individu sain.
Les moyens d'analyse de ce système peuvent être adaptés pour
sélectionner des valeurs qualifiées extrêmes supérieures , supérieures
aux seuils définis ci-dessous pour chaque paramètre :
- PO > 474,62 103,10 pm,
- Roto > 98,96 0,56 %,
- Rond >68,43 14,41 %,
- Feret >169,88 51,08 pm,
- FE >1,745 0,266,

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- Ma/ma >1,653 0,247,
- Dens >0,2837 0,0505;
et le comparateur est adapté pour comparer, pour chaque paramètre, la
moyenne des valeurs extrêmes supérieures et la valeur moyenne de
5 FF à un seuil pathologique défini, pour chaque paramètre, de la manière
suivante :
- FF>10,0 3,6 LUT.5ec-1,
- PO>666,40 103,10 pm,
- Roto>99,32 0,56 %,
10 - Rond>73,00 14,41%,
- Feret>186,11 51,08 pm,
- FE>1,87 0,266,
- Ma/ma>1,90 0,247,
- Dens>0,39 0,0505;
15 le calculateur comprenant en outre un générateur de notes connecté au
comparateur et adapté pour attribuer des notes suivantes :
- si la moyenne des valeurs extrêmes supérieures du
paramètre PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma ou Dens, ou la valeur
moyenne de FF est inférieure au seuil, la note de 0 est attribuée au
paramètre correspondant,
- si la moyenne des valeurs extrêmes supérieures du
paramètre PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma ou Dens, ou la valeur
moyenne de FF est supérieure au seuil, la note de 1 est attribuée pour FF,
PO, Rond, Feret, Dens et la note de 2 est attribuée pour Roto, FE et
Ma/ma,
et le calculateur comprenant en outre un multiplicateur adapter pour
multiplier de la somme des notes par la somme du nombre de valeurs de
chaque paramètre.
Le comparateur du système peut en outre être adapté à comparer la
valeur moyenne de FF et la moyenne des valeurs extrêmes supérieures

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du paramètre PO et Feret à un seuil différentiel défini de la manière
suivante :
- FF>19,86 5,70 LUT.sec-1,
- PO>618,32 98,95 pm et
- Feret>204,68 29,65 pm.
En d'autres termes, le système peut comprendre un
endomicroscope confocal, des moyens de visualisation et des moyens de
calcul, dans lequel lesdits moyens de calcul comprennent :
A) lorsque le système se rapporte à la mise en oeuvre du
procédé ex vivo de quantification des modifications de la muqueuse
intestinale induite par une maladie inflammatoire chronique de l'intestin
chez un individu, des moyens de mesure d'au moins un paramètre choisi
parmi FF, PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma et Dens,
B) lorsque le système se rapporte à la mise en oeuvre du
procédé ex vivo pour le diagnostic d'une maladie inflammatoire chronique
de l'intestin chez un individu:
B1) des moyens de mesure des paramètres FF, PO, Roto,
Rond, Feret, FE, Ma/ma et Dens,
B2) des moyens de sélection des valeurs qualifiées
extrêmes supérieures , supérieures aux seuils définis dans ce procédé,
B3) des moyens de comparaison tels que définis dans ce
procédé,
B4) des moyens d'attribution de notes tels que définis dans
ce procédé, et
B5) des moyens de multiplication notes tels que définis dans
ce procédé ;
C) lorsque le système se rapporte à la mise en oeuvre du
procédé ex vivo pour le diagnostic différentiel de la maladie de Crohn par
rapport à la rectocolite hémorragique chez un individu:
C1 ) les moyens B1) à 135), et

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02) des moyens de comparaison tels que définis dans ce
procédé.
D'autres avantages pourront encore apparaître à l'homme du métier
à la lecture des exemples ci-dessous, illustrés par les figures annexées,
donnés à titre illustratif.
Brève description des figures
¨ La figure 1 représente le schéma du principe de
l'endomicroscopie confocale laser. Le rectangle vertical en haut représente
la source de lumière laser et le détecteur du système confocal. Le
rectangle horizontal représente le sténopé à travers lequel passent des
rayons lumineux. L'ovale horizontal représente une lentille de focalisation.
Le rayonnement laser passe par le centre de la lentille et atteint le tissu.
La
molécule fluorescente présente dans le tissu émet alors de la lumière vers
le haut. Les rayons lumineux en dehors du plan focal sont divergés par la
lentille et ne passent pas par le sténopé. Les rayons lumineux émis par le
plan focal sont convergés par la lentille vers le sténopé et le détecteur.
- La figure 2
représente les paramètres architecturaux considérés
des cryptes. La figure 2A représente le Périmètre d'ouverture de la crypte.
La figure 2B représente le Facteur d'élongation. La figure 20 représente la
Rotondité. La figure 2D représente le Ratio Ma/ma de l'ouverture de la
crypte. La figure 2E représente la Rondeur. La figure 2F représente le
Diamètre de Feret. La figure 2G représente la densité de cryptes par
champ.
¨ La
figure 3 représente la comparaison de la moyenne des
valeurs supérieures au 90e percentile du groupe sain pour les paramètres
suivants : A: Périmètre d'ouverture de la crypte (exprimé en pm), B :
Rotondité (exprimée en %), C: Rondeur (exprimée en %), D: Diamètre de
Feret (exprimé en pm), E: Facteur d'élongation, F: Ma/ma et G: Densité.

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Chacun de ces paramètres est évalué chez 5 individus sains ( S ), 10
individus atteints de la maladie de Crohn ( CD ) et 11 individus atteints
de rectocolite hémorragique ( UC ).
¨ La
figure 4 représente la comparaison de la moyenne des
valeurs de fuite de fluorescence (FF), exprimée en LUT.5ec-1, chez 5
individus sains ( S ), 10 individus atteints de la maladie de Crohn
( CD ) et 11 individus atteints de rectocolite hémorragique ( UC ).
EXEMPLES
Exemple 1 : Validation de biomarqueurs
d'imagerie
diagnostiques des maladies inflammatoires chroniques de l'intestin
par endomicroscopie confocale
Matériel et Méthodes
5 patients sains, 10 patients atteints de la maladie de Crohn (MC) en
phase de rémission inflammatoire clinique (CDAI < 150) et 11 patients
atteints de rectocolite hémorragique (RCH) en phase de rémission
inflammatoire clinique (Score de Mayo <1) ont été inclus dans cette étude
rétrospective.
La fuite de fluorescence (FF) dans la muqueuse colique, le périmètre
d'ouverture (PO), la rondeur (Rond), la rotondité (Roto), le facteur
d'élongation (FE), le diamètre de Feret (Feret), le rapport grand axe sur
petit axe (Ma/ma) et la densité (Dens) des puits de crypte ont été quantifiés
par mesure ou calcul de ces paramètres au moyen des images
d'endomicroscopie confocale (ColoFlex UHD, Cellvizio, Mauna Kea
Technologies).
Seules les valeurs supérieures au 90e centile des patients sains ont
été considérées pour l'analyse (valeurs qualifiées de extrêmes
supéreures ).
Résultats

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L'analyse quantitative a été réalisée sur 91 8 cryptes par patients.
Nous avons pu mettre en évidence que la moyenne des valeurs
supérieures au 90ème centile des patients sains de la rotondité (Roto)
(p<0,01), de la rondeur (Rond) (p<0,05), du diamètre de Feret (Feret)
(p<0,05), du facteur d'élongation (FE) (p<0,01), du rapport Ma/ma (p<0,01)
sont significativement plus élevées pour le groupe MC comparé aux
patients sains (cf. figure 3).
La moyenne des valeurs supérieures au 90ème centile des patients
sains du périmètre d'ouverture (PO) (p<0,05), de la rotondité (Roto)
(p<0,01), du diamètre de Feret (Feret) (p<0,01), du facteur d'élongation
(FE) (p<0,01), du rapport Ma/ma (p<0,01) et de la densité (Dens) de
l'image en crypte (p<0,05) sont significativement plus élevées pour le
groupe RCH comparé aux patients sains (cf. figure 3).
La moyenne des valeurs supérieures au 90ème centile des patients
sains du périmètre d'ouverture (PO) (p<0.05) et du diamètre de Feret
(Feret) (p<0,05) sont significativement plus élevées pour le groupe RCH
comparé au groupe MC (cf. figure 3).
Finalement, nous avons observé dans le groupe RCH 5,9 fois plus de
fuite de fluorescéine (FF) dans la muqueuse colique comparé au groupe
sain (p<0.05) et 2,9 fois plus comparé au groupe MC (p<0.05) (cf. figure 4).
Conclusion
Cette étude démontre que nous pouvons quantifier les modifications
architecturales de la muqueuse induite par les MICI, même lors d'une
rémission clinique. Nous avons pu définir 3 types de paramètre : 1/ les
paramètres communs aux MICI (Rotondité, Diamètre de Feret, facteur
d'élongation, Ma/ma) ; 2/ un paramètre spécifique de la maladie de Crohn
(Rondeur) et 3/ des paramètres spécifiques de la rectocolite hémorragique
(Fuite de fluorescence, Périmètre d'ouverture et Densité).
Ces résultats posent les bases pour établir un score optique des MICI
qui pourra servir au diagnostic et au suivi de la réponse thérapeutique.

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Ces résultats valident également l'utilisation de biomarqueurs
d'imagerie diagnostiques aux MICI et spécifiquement à la MC et la RCH.
5 Exemple 2: Validation d'un score diagnostique par imagerie
endomicroscopique des MICI, de la MC et de la RCH
Matériel et Méthodes
5 patients sains, 10 patients atteints de la maladie de Crohn (MC) en
10 phase de rémission inflammatoire clinique (CDAI < 150) et 11
patients
atteints de rectocolite hémorragique (RCH) en phase de rémission
inflammatoire clinique (Score de Mayo <1) ont été inclus dans cette étude
rétrospective. La fuite de fluorescence (FF) dans la muqueuse colique, le
périmètre d'ouverture (PO), la rondeur (Rond), la rotondité (Roto), le
15 facteur d'élongation (FE), le diamètre de Feret (Feret), le rapport
grand axe
sur petit axe (Ma/ma) et la densité (Dens) des puits de crypte ont été
quantifiés par mesure ou calcul de ces paramètres au moyen des images
d'endomicroscopie confocale (ColoFlex UHD, Cellvizio, Mauna Kea
Technologies).
20 Seules les valeurs supérieures au 90e centile des patients sains ont
été considérées pour l'analyse (valeurs qualifiées de extrêmes
supéreures ).
Le score diagnostique des MICI est défini par:
1-
Sélection des valeurs extrêmes supérieures , c'est-à-dire
des valeurs supérieures au 90ème centile des patients sains pour chacun
des paramètres PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma et Dens.
La valeur du 90ème centile des patients sains pour chacun des
paramètres est mesurée/calculée, avec les résultats suivants :
- PO > 474,62 103,10 pm,
- Roto > 98,96 0,56 %,
- Rond >68,43 14,41 %,

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- Feret >169,88 51,08 pm,
- FE >1,745 0,266,
- Ma/ma >1,653 0,247,
- Dens >0,2837 0,0505;
2- Pour chacun de
ces paramètres, la moyenne des valeurs
extrêmes supérieures , c'est-à-dire supérieures au 90ème centile des
patients sains, et la valeur moyenne de FF sont comparées à un seuil
pathologique définit par une consensus d'experts. Le seuil pathologique,
pour chaque paramètre, est ainsi définit par les valeurs suivantes :
- FF>10 LUT.sec-1,
- PO>666,40 pm,
- Roto>99,32%,
- Rond>73,00%,
- Feret>186,11pm,
- FE>1,87,
- Ma/ma>1,90,
- Dens>0,39.
Si la moyenne des valeurs extrêmes supérieures du paramètre
PO, Roto, Rond, Feret, FE, Ma/ma ou Dens, ou la valeur moyenne de FF
est inférieure au seuil pathologique, la note de 0 est attribuée au
paramètre. Si cette valeur est supérieure au seuil pathologique, la note de
1 est attribuée pour FF, PO, Rond, Feret, Dens et la note de 2 est attribuée
pour Roto, FE et Ma/ma.
3- La somme des notes est multipliée par la somme du nombre
de valeurs de chaque paramètre. Dans cet exemple, un total supérieur à
204 définit le patient comme atteint d'une MICI.
4- Pour les patients définis MICI, la valeur moyenne de FF et la
moyenne des valeurs extrêmes supérieures de PO et Feret sont
comparées à un seuil différentiel définit par un consensus d'experts. Le
seuil différentiel, pour chacun de ces paramètres, est ainsi définit par les
valeurs suivantes :

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- FF>19,86 LUT.sec-1,
- PO>618,32 pm
- Feret>618,32 pm.
Si, pour chacun de ces 3 paramètres, une valeur supérieure au seuil
différentiel correspondant au paramètre considéré est mesurée/calculée,
alors le patient est défini comme atteint d'une RCH. Dans le cas contraire,
c'est-à-dire si l'un au moins des paramètres n'a pas une valeur supérieure
au seuil différentiel du paramètre correspondant, alors le patient est défini
comme atteint d'une MC.
'o
Résultats
Les valeurs du 90ème centile de la population saine sont : Périmètre
d'ouverture (> 474,62 pm), Rotondité (> 98,96%), Rondeur (>68,43%),
Diamètre de Feret (>169,88 pm), Facteur d'élongation (>1,745), Ma/ma
(>1,653) et densité (>0,2837).
Les valeurs, occurrences, scores et diagnostics de MICI sont
résumés dans le tableau 1. La spécificité, la sensibilité, la valeur
prédictive
(VPP) positive et négative (VPN) sont de 100 % pour ce groupe de
patients.

23
0
I.)
o
--,
Tableau 1:
-4
ui
ce
1..
oe
Périmètre d'ouverture Rotondité Rondeur
Diamètre de Feret o
Patient
Moyenne Point Occurrence Moyenne Point Occurrence Moyenne Point Occurrence
Moyenne Point Occurrence
1 sain 564,06 0 7 99,31 0 5 70,35 0
9 0 0 0
P
2 sain 603,092 0 4 99,26 0 3 72,33 0
4 o o o .
3 sain 737,324 1 4 99,19 0 2 75,6 1
2 216,3896 1 8
,-,
,
4 sain 515,508 0 3 99,21 0 2 o o
o 175,9772 0 9
o
sain 525,98 0 1 99,31 0 7 69,02 0
4 185,9256 0 2
,-,
,
6 MICI MC 584,052 0 6 99,6 2 21 73,36 1 24
201,11 1 7
- ,
,-,
7 MICI MC 612,612 0 9 99,53 2 7 73,12 1 10
216,342 1 6
8 MICI MC 642,124 0 44 99,74 2 16 74,67 1 24
237,3336 1 56
9 MICI MC 544,544 0 17 99,27 0 3 75,62 1 10
206,4888 1 28
10 MICI MC 667,828 1 31 99,68 2 32 73,64 1 37
235,1916 1 47
11 MICI MC 825,384 1 6 99,85 2 27 76 1
29 256,1356 1 10
12 MICI MC 751,128 1 31 99,72 2 6 74,2 1 7
249,8524 1 41
so
13 MICI MC 695,436 1 19 99,65 2 24 74 1 19
238,714 1 34 n
,-q
14 MICI MC 490,756 0 1 99,73 2 13 73,54 1 24
186,6396 1 6 0=1'
15 MICI MC 593,096 0 8 99,79 2 13 74,43 1 20
202,9188 1 20
--.1
16 MICI MC 754,936 1 21 99,57 2 7 75,29 1 8
247,996 1 30 o
uh
17 MICI RCH 857,752 1 11 99,8 2 54 74,61 1 57
252,518 1 18 o
uh
oe
18 MICI RCH 766,836 1 35 99,7 2 20 73,14 1 19
260,6576 1 43 o

24
0
I.)
o
--,
19 MICI RCH 689,248 1 10 99,64 2 17 74,05 1 30
219,3408 1 15 --.1
,-,
un
20 MICI RCH 904,4 1 16 99,61 2 36 75,22 1 40
313,3984 1 16 ce
I.)
oe
21 MICI RCH 731,136 1 3 99,76 2 40 73,45 1 39
276,7464 1 4
22 MICI RCH 601,664 0 5 99,51 2 9 71,72 0 29
212,8672 1 8
23 MICI RCH 666,4 0 13 99,61 2 39 73,67 1 60
246,7584 1 15
24 MICI RCH 838,236 1 3 99,47 2 12 74,86 1 20
243,5692 1 6
25 MICI RCH 753,508 1 35 99,84 2 6 71,34 0 10
282,744 1 37
26 MICI RCH 788,256 1 31 99,68 2 9 71,64 0 9
285,4572 1 34
Tableau 1 (suite) :
P
,
,
,
r.,
Facteur d'élongation Ma/ma
Densité Fuite de fluorescence Score
diagnostique
de MICI
,
Moyenn
Point Occurren Moyen
Point Occurren Moyen
Point Occurren Moyen
Point Occurren (rétrospectif)
.
'
,-,
e ce ne ce ne ce ne
ce
0 0 0 0 0 0 0,3672 0 3 11,15 1
NA 24 sain
1,869 0 10 1,784 0 10 0,3426 0 4 5,1 0
NA 0 sain
2,021 2 6 1,884 0 7 0,4695 1 5 2,08 0
NA 204 sain
1,843 0 3 1,712 0 2 0 0 0 3,77 0
NA 0 sain
0 0 0 0 0 0 0,3114 0 1 8,26 0
NA 0 sain
so
2,092 2 16 2,121 2 9 0,4217 1 15 12,14 1
NA 980 MICI n
,-q
1,968 2 3 1,787 0 3 0,3645 0 7 19,87 1
NA 315 MICI 0=1'
2,426 2 43 2,015 2 22 0,4429 1 47 10,21 1
NA 2520 MICI
2,074 2 24 1,865 0 8 0,5579 1 29 12,4 1
NA 714 MICI --.1
ID
un
2,536 2 42 2,074 2 28 0,4522 1 48 6,835 0
NA 2650 MICI ID
un
oe
2,146 2 8 1,814 0 4 0,4202 1 43 11,97 1
NA 1143 MICI c:,

25
0
ID"
2,493 2 22 2,061 2 10 0,3713 0 15 14,92 1
NA 1320 MICI 1
ul
2,4 2 38 1,993 2 25 0,4494 1 40 1,32 0
NA 1990 MICI NI
1,995 2 17 1,915 2 9 0,3983 1 17 7,64 0
NA 783 MICI cre'
2,284 2 28 2,045 2 11 0,3956 1 22 23,68 1
NA 1220 MICI
2,313 2 20 2,109 2 15 0,4855 1 32 19,87 1
NA 1463 MICI
1,976 2 24 1,898 0 18 0,4375 1 37 28,87 1
NA 1971 MICI
2,347 2 34 2,164 2 20 0,5083 1 44 9,81 0
NA 2150 MICI
2,389 2 24 1,973 2 18 0,4977 1 37 23,82 1
NA 1661 MICI
2,39 2 12 1,967 2 5 0,5951 1 17 70,32 1
NA 1562 MICI
P
2,539 2 4 1,914 2 2 0,3929 1 16 37,88 1
NA 1188 MICI ,9
o
2,358 2 8 1,927 2 6 0,4042 1 17 50,59 1
NA 738 MICI
,1
2,147 2 19 1,921 2 9 0,4305 1 26 23,79 1
NA 1810 MICI o
r.,
1,893 2 4 1,675 0 2 0,4 1 23 50,41 1
NA 630 MICI '-9
à
2,681 2 28 2,271 2 17 0,5042 1 45 58,6 1
NA 1780 MICI .
,
2,461 2 29 2,065 2 16 0,5632 1 37 23,15 1
NA 1650 MICI
md
n
,-q
0=1'
--..,
une'
une'
cre'

CA 03017720 2018-09-13
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WO 2017/158286
PCT/FR2017/050586
Les valeurs et diagnostics différentiels sont résumé dans le tableau 2.
Pour le diagnostic de la MC, la spécificité est de 87,5 %, la sensibilité
de 100%, la VPP de 83,3 % et la VPN de 100 %.
Pour le diagnotic de la RCH, la spécificité est 100 %, la sensibilité de
81,8 %, la VPP de 100 % et la VPN de 88,2 %.

27
0
I.)
o
--,
Tableau 2:
-4
ui
ce
1..
Score diagnostique
oe
Périmètre Fuite
de Diagnostic o
Patient de MICI Diamètre de Feret
d'ouverture
fluorescence différentiel
(rétrospectif)
6 MICI MC 980 MICI 584,052 201,11 12,14
MC
7 MICI MC 315 MICI 612,612 216,342 19,87
MC
8 MICI MC 2520 MICI 642,124 237,3336 10,21
MC
9 MICI MC 714 MICI 544,544 206,4888 12,4
MC
MICI MC 2650 MICI 667,828 235,1916
6,835 MC P
11 MICI MC 1143 MICI 825,384
256,1356 11,97 MC
=,
,-,
,
12 MICI MC 1320 MICI 751,128
249,8524 14,92 MC ,
13 MICI MC 1990 MICI 695,436 238,714
1,32 MC
,-,
,
14 MICI MC 783 MICI 490,756
186,6396 7,64 MC o
,
MICI MC 1220 MICI 593,096 202,9188
23,68 MC
16 MICI MC 1463 MICI 754,936 247,996
19,87 RCH
17 MICI RCH 1971 MICI 857,752 252,518
28,87 RCH
18 MICI RCH 2150 MICI 766,836
260,6576 9,81 MC
19 MICI RCH 1661 MICI 689,248
219,3408 23,82 RCH
MICI RCH 1562 MICI 904,4 313,3984
70,32 RCH
so
21 MICI RCH 1188 MICI 731,136
276,7464 37,88 RCH n
,-q
22 MICI RCH 738 MICI 601,664
212,8672 50,59 MC 0=1'
23 MICI RCH 1810 MICI 666,4
246,7584 23,79 RCH
24 MICI RCH 630 MICI 838,236
243,5692 50,41 RCH --.1
o
MICI RCH 1780 MICI 753,508 282,744
58,6 RCH un
o
un
oe
26 MICI RCH 1650 MICI 788,256
285,4572 23,15 RCH o

CA 03017720 2018-09-13
28
WO 2017/158286
PCT/FR2017/050586
Conclusion
Cette étude démontre que le score endomicroscopique établi permet
le diagnostic d'une MICI, même en état de rémission inflammatoire
clinique. Ce score couplé à l'utilisation de 3 autres biomarqueurs (FF, PO
et diamètre de Feret) permet également de différencier les MC des RCH.
Exemple 3 : Validation d'un score diagnostique par imagerie
endomicroscopique des MICI (MC et RCH)
Matériel et Méthodes
4 patients sains, 13 patients atteints de la maladie de Crohn (MC) en
phase de rémission inflammatoire clinique (CDAI < 150) et 16 patients
atteints de rectocolite hémorragique (RCH) en phase de rémission
inflammatoire clinique (Score de Mayo <1) ont été inclus dans cette étude
rétrospective. Les paramètres décrits dans l'exemple 2 ont été quantifiés
par mesure ou calcul de ces paramètres au moyen des images
d'endomicroscopie confocale (ColoFlex UHD, Cellvizio, Mauna Kea
Technologies).
Seules les valeurs supérieures au 90e centile des patients sains ont
été considérées pour l'analyse (valeurs qualifiées de extrêmes
supérieures ). Le score diagnostique est construit comme précédemment
décrit. Le diagnostic différentiel est construit à partir de FF (>19,86 5,70
LUT.sec-1), PO (>618,32 98,95 pm) et Feret (>204,68 29,65 pm)
comme précédemment décrit.
Résultats
Les résultats sont résumés dans le tableau 3.

29
0
1.J
o
,-,
Tableau 3:
-4
ui
ce
1-J
Diagnostic
ce
N Diagnostic Diagnostic
différentiel
rétrospectif
patient à
MC
série 2 l'inclusion Score Sain/MICI FF PO
Feret
/RCH
1 Sain 1 Sain
2 Sain 172 Sain
3 Sain 0 Sain
4 Sain 296 MICI -------"--
P
MC 720 MICI 20,87 744,75 367,26 RCH
.
6 MC 456 MICI
23,185 557,93 206,21 MC ,
,
,
7 MC 1211 MICI
9,9 847,17 296,94 MC
-
N)
8 MC 2000 MICI
11,21 728,88 262,29 MCo
,
9 MC 1152 MICI
13,95 859,54 311,17 MC
,
MC 627 MICI 6,06 677,67 238,51 MC
,
11 MC 1184 MICI
22,46 697,33 251,08 RCH
12 MC 1140 MICI
34,18 708,28 254,43 RCH
13 MC 2112 MICI
33,41 553,52 201,3 MC
14 MC 62 Sain 3,89 0
0 MC
MC 3374 MICI 8,16 875,5 314,47 MC
16 MC 1904 MICI
16,56 889,23 328,48 RCH
n
17 MC 1112 MICI
19,49 859,54 311,17 RCH
-=.1=-
18 RCH 252 MICI
7,326 647,17 225,6 MC
19 RCH 3724 MICI
26,14 697,06 240,68 RCH -4
RCH 1435 MICI 19,4675 741,9 258,98
RCH =
ui
21 RCH 3530 MICI
29,96 664,13 246,18 RCH =
ui
ce
22 RCH 1425 MICI
7,326667 719,18 264,71 MC c.,

30
0
I.)
o
,-,
23 RCH 425 MICI 22,614 647,28
232,59 RCH -4
24 RCH 930 MICI 44,374 707,06
242,93 RCH ui
ce
14
25 RCH 3059 MICI 37,88 605,3
215,47 MC e
26 RCH 1362 MICI 18,784 736,61
242,4 RCH
27 RCH 748 MICI 12,6 690,25
236,94 MC
28 RCH 1350 MICI 23,84 689,14
238,69 RCH
29 RCH 355 MICI 3,416667
655,85 223,13 MC
30 RCH 258 MICI 14,52 615,79
215,41 MC
31 RCH 978 MICI 19,30667
664,56 231,84 RCH
32 RCH 3240 MICI 7,43 758,54
275,53 MC P
33 RCH 1115 MICI 21,935 696,47
242,17 RCH LD
à
,i-
à
à
,
md
n
,-q
-=1=-
-4
=
ui
=
ui
ce
c.,

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WO 2017/158286
PCT/FR2017/050586
La sensibilité du diagnostic de MICI est de 96,55% pour une
spécificité de 75 %. La sensibilité du diagnostic différentiel RCH/MC est
68,75 % pour une spécificité de 61,54 %.
Conclusion
Cette étude démontre la validité du score endomicroscopique établi
et permet le diagnostic d'une MICI, même en état de rémission
inflammatoire clinique. Ce score couplé à l'utilisation de 3 autres
biomarqueurs (FF, PO et Feret) permet également de différencier les MC
des RCH.
L'ensemble de la population étudiée (exemple 2 et exemple 3)
démontre que le score diagnostique permet l'identification d'une MICI avec
une sensibilité de 98% et une spécificité de 89%. Le diagnostic différentiel
est sensible à 65,4% et spécifique à 75 %.

CA 03017720 2018-09-13
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WO 2017/158286
PCT/FR2017/050586
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Common Representative Appointed 2019-10-30
Common Representative Appointed 2019-10-30
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Description 2023-08-24 36 1,991
Claims 2023-08-24 5 251
Description 2023-08-24 36 2,314
Claims 2023-08-24 5 251
Claims 2018-09-13 6 174
Drawings 2018-09-13 4 107
Abstract 2018-09-13 2 87
Description 2018-09-13 32 1,147
Representative drawing 2018-09-13 1 35
Cover Page 2018-09-21 1 48
Commissioner's Notice - Maintenance Fee for a Patent Application Not Paid 2024-04-26 1 567
Courtesy - Certificate of registration (related document(s)) 2019-01-16 1 106
Notice of National Entry 2018-10-01 1 194
Reminder of maintenance fee due 2018-11-19 1 111
Courtesy - Acknowledgement of Request for Examination 2022-04-13 1 423
Amendment / response to report 2023-08-24 36 1,411
National entry request 2018-09-13 6 158
International search report 2018-09-13 10 301
Request for examination 2022-03-09 4 114
Amendment / response to report 2022-05-05 7 238
Examiner requisition 2023-05-30 5 247